「リンク数が100個以上になってしまうと問題が生じる」「サブページへのページランク振り分けが少なくなり、サブページの上位表示が不利になる」など、トップページ相互リンクのデメリットが指摘されていますが、ブッチャはそれらのデメリットが問題なのではなく「訪問者にとっての使いやすさに反する」ことが最大の問題だと考えています。
トップページに広告は貼らない！と言っているサイトでも、トップページ相互リンクはおこなっています。相互リンクも一種の広告だと思うのですが・・・。
いずれこの問題も検索エンジン側で調整・改善されていくと思います。
しかし、サイト初級者・中級者の方にトップページ相互リンクをしないという「茨の道」を強要することはできません。
ご自身の判断でどうぞ。トップページ相互リンクが「悪」だと言うわけではありません。